Ook in de derde vrije training voor de Grand Prix van Japan heeft Lewis Hamilton de snelste tijd genoteerd. Tien minuten voor het einde dook de regerend wereldkampioen onder de tijd van Sebastian Vettel, die op zijn beurt weer sneller was dan Kimi Raikkonen. Daarachter volgde Max Verstappen op P4.

De zaterdag op Suzuka begon met drukte op de baan. Vrijwel alle coureurs gingen zo snel mogelijk naar buiten door de dreigende regen rond het circuit. Kimi Raikkonen was de eerste die een representatieve tijd reed en zijn 1:30.054 bleef langer op de eerste positie staan dan verwacht. Na ruim 10 minuten waren de druppels zichtbaar en voelbaar op het circuit en dat resulteerde erin dat Hamilton na de eerste runs laatste stond. De Brit leek op weg naar de eerste plek, maar blokkeerde in de laatste chicane zijn rechter voorwiel en schoot rechtdoor.

De regen bleef intussen zachtjes vallen, waardoor alle coureurs na een kwartier alweer teruggekeerd waren in de pits. Pas met een half uur te gaan kwamen de coureurs weer voorzichtig het circuit op, met Bottas die als eerste aftastte hoe het circuit erbij lag.

De toestand van het circuit bleek uiteindelijk prima te zijn, want in de slotfase werd de snelste tijd van Raikkonen eindelijk verbeterd. Vettel reed eerst een 1:29.715, maar een aantal seconden later scherpte Hamilton die tijd verder aan met 1:29.599. Verstappen klom ten koste van Valtteri Bottas naar de vierde plek, terwijl Daniel Ricciardo de zesde tijd noteerde. Nico Hülkenberg zorgde voor een vroeg slotakkoord tijdens VT3: met nog drie minuten te gaan knalde de Renault van de Duitser in de bandenstapels.